Úkoly řešené Ústavem živočišné fyziologie a genetiky AV ČR se pohybují od výrazně biomedicínských po biodiverzitně orientovaná témata, jež jsou propojena společnou linií sledování fyziologických a genetických parametrů, včetně aplikace obdobných experimentálních metod.
Ústav se skládá ze čtyř sekcí, které jsou dále rozděleny na 11 laboratoří umístěných v Liběchově, Praze a Brně. Má několik společných pracovišť s vysokými školami i jinými výzkumnými ústavy v ČR, je zapojen do Centra buněčné terapie a tkáňových náhrad a rozvíjí rozsáhlou mezinárodní spolupráci s renomovanými vědeckými pracovišti od amerického až po asijský kontinent.